Facultad: IngenieríaMaestría: Maestría en Biología ComputacionalMateria: Metagenómica ASVs vs. OTUs Las unidades taxonómicas operacionales (OTUs) son grupos de lecturas que difieren entre sí en menos de un límite determinado, generalmente 3 %. Existen métodos...
Herramientas para el análisis metagenómico funcional
por hryepez | Oct 6, 2021 | Ingeniería, Presentaciones
Facultad: IngenieríaMaestría: Maestría en Biología ComputacionalMateria: Metagenómica Herramientas para el análisis metagenómico funcional NO EXISTE UN GOLD STANDARD PARA EL ANÁLISIS BIOINFORMÁTICO DE METAGENOMAS. LA ELECCIÓN DE LAS HERRAMIENTAS A UTILIZAR DEPENDERÁ...
Ensamblaje y anotación
por hryepez | Oct 6, 2021 | Ingeniería, Presentaciones
Facultad: IngenieríaMaestría: Maestría en Biología ComputacionalMateria: Metagenómica Ensamblaje y anotación La búsqueda basada en actividad utiliza clones que se expresan en un sustrato específico que permite observar un cambio conspicuo. La búsqueda basada...
Secuenciación Shotgun
por hryepez | Oct 6, 2021 | Ingeniería, Presentaciones
Facultad: IngenieríaMaestría: Maestría en Biología ComputacionalMateria: Metagenómica Secuenciación Shotgun Qué hay? Perfil taxonómico Riqueza Proporciones Que hacen? Química funcional Sustratos consumidos y productos Cómo lo hacen? Rutas metabólicas Estratificación...
Análisis Metagenómico con y sin Referencia
por hryepez | Oct 6, 2021 | Ingeniería, Presentaciones
Facultad: IngenieríaMaestría: Maestría en Biología ComputacionalMateria: Metagenómica Análisis Metagenómico con y sin Referencia El agrupamiento (binning) metagenómico es el proceso en el que se clasifican secuencias de acuerdo al grupo taxonómico al que pertenecen....
Pipelines Bioinformáticos
por hryepez | Oct 6, 2021 | Ingeniería, Presentaciones
Facultad: IngenieríaMaestría: Maestría en Biología ComputacionalMateria: Metagenómica Pipelines Bioinformáticos Código iFrame
Secuenciación Masiva Paralela
por hryepez | Oct 6, 2021 | Ingeniería, Presentaciones
Facultad: IngenieríaMaestría: Maestría en Biología ComputacionalMateria: Metagenómica Secuenciación Masiva Paralela Preparación de la secuencia molde (template): Fragmentación Adaptadores Inmovilización Clonaje Cadena única Código iFrame
Evaluando expresión diferencial en R y Python
por hryepez | Oct 6, 2021 | Ingeniería, Presentaciones
Facultad: IngenieríaMaestría: Maestría en Biología ComputacionalMateria: Transcriptomica Evaluando expresión diferencial en R y Python Todas las herramientas que realizan análisis de expresión diferencial (DGE) están basadas en dos principios principales: Código...
Métodos para evaluar expresión diferencial
por hryepez | Oct 6, 2021 | Ingeniería, Presentaciones
Facultad: IngenieríaMaestría: Maestría en Biología ComputacionalMateria: Transcriptomica Métodos para evaluar expresión diferencial Es un análisis donde se toman los datos de expresión normalizados y se llevan a cabo análisis estadísticos para descubrir cambios...
Normalización de lecturas de secuenciación
por hryepez | Oct 6, 2021 | Ingeniería, Presentaciones
Facultad: IngenieríaMaestría: Maestría en Biología ComputacionalMateria: Transcriptomica Normalización de lecturas de secuenciación Después que se estima el conteo de los transcritos es importante normalizar los datos para poder comparar niveles de expresión entre...