Herramientas y recursos para Biología Computacional

Herramientas y recursos para Biología Computacional

Los desafíos de este año puestos por la International Society for Computational Biology (ISCB) estuvieron orientados al mejoramiento de la salud utilizando bioinformática. A continuación se detallan los temas principales.
Descubrimiento de fármacos
Screening genético
Diagnósticos personalizados
En las siguientes diapositivas usted encontrara varias ideas, recursos y herramientas para ayudarle en su proyecto en Biología computacional.

Recursos, bases de datos del internet, y SQL.

Recursos, bases de datos del internet, y SQL.

Lo que distingue a una base de datos relacional de un archivo plano o una hoja de cálculo es la capacidad de utilizar álgebra relacional para crear consultas sofisticadas que proporcionan muchas vistas alternativas de los datos o subconjuntos de datos. El idioma utilizado para hacer esto se llama Structured Query Language, o SQL, un lenguaje declarativo para consultar datos en los que describe lo que desea ver.​

Análisis de datos de secuenciación del ARN

Análisis de datos de secuenciación del ARN

Un objetivo común en RNAseq es identificar genes y / o transcripciones que se expresan en diferentes niveles entre nuestros grupos de muestras definidos por el usuario.​

La cuantificación absoluta del nivel de expresión del gen está sujeta a sesgos de medición (sesgo de GC en PCR y / o captura / selección de ARN), por lo que es más apropiado comparar los niveles de expresión del mismo gen en diferentes condiciones que comparar la expresión de genes diferentes. niveles dentro de una condición.​

Biopython

Biopython

Biopython es un paquete extenso de herramientas, clases y funciones de Python para bioinformática y biología computacional. ​

Se lanzó por primera vez en el año 2000 y ahora contiene más de 300 módulos para tratar con datos biológicos. ​